Studia doktoranckie na Wydziale Prawa i Administracji Uniwersytetu Jagiellońskiego są stacjonarnymi studiami III stopnia. Trwają 4 lata i ich zadaniem jest przygotowanie uczestników do pracy naukowej oraz takie poszerzenie wiedzy, które zaowocuje napisaniem i obroną pracy doktorskiej. Uczestnicy studiów doktoranckich odbywają studia według programu uchwalonego przez Radę Wydziału Prawa i Administracji UJ.

Wyróżniającym się doktorantom może zostać przyznane stypendium doktoranckie. Stypendium przyznawane jest oddzielnie na okres każdego roku akademickiego począwszy od roku drugiego. Studenci studiów doktoranckich mają prawo do świadczeń z Funduszu Pomocy Materialnej dla Studentów i Doktorantów utworzonego przez Uniwersytet Jagielloński ze środków przeznaczonych na ten cel w budżecie państwa.

Po uzyskaniu wymaganych zaliczeń i zdaniu egzaminów, przedstawieniu rozprawy doktorskiej oraz pomyślnym przebiegu jej publicznej obrony, absolwent na podstawie uchwały Rady Wydziału uzyskuje stopień doktora nauk prawnych w określonej specjalności prawa.